Emamifar S, Abolmaali S, Mohammadi M, Sohrabi S. Identification, cloning and characterization of some antimicrobial peptide defensin from oat plant Avena sativa. MGj 2019; 13 (4) :503-512
URL:
http://mg.genetics.ir/article-1-85-fa.html
امامیفر سارا، ابوالمعالی شمس الضحی، محمدی محسن، سهرابی سید محسن. شناسایی، همسانهسازی و بررسی برخی ژنهای ضد میکروبی دیفنسین گیاه یولاف Avena sativa. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1397; 13 (4) :503-512
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-85-fa.html
گروه بیوتکنولوژی و فارماکوگنوزی، دانشکده داروسازی دانشگاه علوم پزشکی لرستان، خرم آباد، ایران
چکیده: (2033 مشاهده)
ظهور و گسترش مقاومت آنتی بیوتیکی در میان باکتریهای بیماریزا یک تهدید جدی سلامت عمومی در جهانی است. به خاطر افزایش مقاومت به آنتی بیوتیکهای مرسوم، بیشتر مطالعات روی توسعه پپتیدهای ضد میکروبی بهعنوان یک درمان جایگزین متمرکز شدهاند. دیفنسینها گروهی از پپتیدهای ضد میکروبی غنی از سیستئین هستند که در گیاهان و جانوران وجود دارند. این پپتیدها در گیاهان بهعنوان یک مکانیسم دفاعی علیه پاتوژنها و آفات عمل میکنند. هدف از این تحقیق، شناسایی برخی از ژنهای دیفنسین از گیاه یولاف و بررسی ویژگیهای آنها بود. به این منظور، خانواده ژنی دیفنسین گیاه گندم از بانک ژن دریافت و علیه ترانسکریپتوم گیاه یولاف مورد همردیفی قرار گرفت. توالیهای حاصل از همردیفی جمعآوری و سرهمبندی شدند و سپس کانتیگها و سینگلتونهای بهدست آمده با استفاده از ابزار BLASTn، علیه پایگاه داده نوکلئوتیدی همردیف شدند. توالیهای حاصل برای وجود چارچوب خوانش باز کامل بررسی و از توالیهای حاوی چارچوب خوانش باز کامل برای طراحی آغازگرها استفاده شد. در مرحلهی بعد، از مخلوط بافتهای (ریشه، ساقه و برگ) گیاه یولاف استخراج RNA صورت گرفت و cDNA ساخته شد. قطعات 327، 340، 375، 391 و 397 جفتبازی بوسیله PCR تکثیر و در ناقل pTZ57R/T همسانه سازی و توالییابی شدند. نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی، وجود 9 توالی کدکننده برای ژنهای دیفنسین را در ترانسکریپتوم گیاه یولاف مشخص کرد. از این تعداد 5 ژن همسانهسازی و تعیین توالی شدند. این ژنها دارای چارچوبهای خوانش باز بین 246-234 بودند و پپتیدهایی به طول بین 81- 77 اسید آمینه را کد میکردند. توالی پپتیدی دیفنسینهای شناسایی شده، دارای دمین عملکردی Knot1 از خانواده gamma-thionin بود. شناسایی ژنها و بررسی خصوصیات آنها، اولین قدم در مهندسی ژنتیک و تولید موجودات با صفات مفید است. در این تحقیق برای اولین بار، توالی کدکنندهی 5 ژن دیفنسین از گیاه یولاف جداسازی شد و ساختار و ویژگیهای مختلف آنها مورد بررسی قرار گرفت.
نوع مطالعه:
پژوهشی کامل |
موضوع مقاله:
ژنتیک گیاهی دریافت: 1397/3/2 | پذیرش: 1397/12/15 | انتشار: 1398/7/10