دوره 15، شماره 1 - ( 5-1399 )                   جلد 15 شماره 1 صفحات 41-47 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

sadeghi Z, Nasrollanejad S, lagzian M, Razavi E, jafari M. Bioinformatics study on the role of homolog heat shock protein 70 gene of Iranian isolates of Cucurbit chlorotic yellows virus in increasing genetic variation. MGj. 2020; 15 (1) :41-47
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-90-fa.html
صادقی زهرا، نصرالله نژاد سعید، لگزیان میلاد، رضوی اسماعیل، جعفری مجید. بررسی بیوانفورماتیکی پروتئین شوک حرارتی جدایه‌های ایرانی ویروس زردی کلروتیک کدوئیان (Cucurbit chlorotic yellows virus) در افزایش تفاوت ژنتیکی. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1399; 15 (1) :41-47

URL: http://mg.genetics.ir/article-1-90-fa.html


گروه گیاهپزشکی
چکیده:   (143 مشاهده)

پروتئین شوک حرارتی در کلستروویروس‌ها نقش­های متعددی به‌ویژه حرکت سلول- به- سلول را برای ایجاد آلودگی سیستمیک بر عهده دارد. در پژوهش حاضر، تفاوت ژنتیکی ژن همولوگ پروتئین شوک حرارتی (HSP70h) جدایه‌های ایرانی ویروس زردی کلروتیک کدوئیان و همچنین فشار انتخاب وارد شده بر آن­ها بررسی شد .به این منظور تعداد 195 نمونه با علایم زردی، کوتولگی و بدشکلی برگ­ها از مزارع کدوئیان استان سیستان و بلوچستان جمع‌آوری و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی، از منطقه ژنتیکی پروتئین همولوگ شوک حرارتی ویروسCCYV  قطعه‌ای به‌طول 462 جفت‌باز برای 15 نمونه توسط روش RT-PCR تکثیرشد و 7 جدایه مورد بررسی فیلوژنتیکی قرار گرفت. نتایج به‌دست آمده نشانگر آلودگی 7 درصد نمونه‌ها به ویروس زردی کلروتیک کدوئیان در مناطق مورد بررسی بود. آنالیزفیلوژنی توالی‌های نوکلئوتیدی و اسید آمینه‌ای جدایه‌های CCYV را به دو گروه ایرانی و شرق آسیا تقسیم نمود و جدایه‌های سیستان و بلوچستان در دو شاخه مجزا قرارگرفتند. هم‌ردیفی توالی اسیدآمینه فرضی پروتئین همولوگ شوک حرارتی و مطالعات فشار انتخاب بر روی 7 جدایه موجود در تحقیق با 3 جدایه ایرانی و جدایه­های خارجی این ویروس نشان داد که ژن HSP70h در جدایه­های ایرانی و سایر جدایه­های این ویروس تحت فشار انتخاب مثبت در کدون 82 قرار دارند که منجر به تغییر یک اسید نوکلئیک (CTC به TTC) به‌ترتیب برای جدایه‌های مرکزی و جدایه­های زابل، هیرمند و نیمروز در موقعیت 244 شده و اسید آمینه لوسین به فنیل آلانین در پروتئین همولوگ شوک حرارتی تغییر نموده است. نتایج نشان‌دهنده وجود جدایه‌های متنوع ویروس CCYV  در کشور بوده و تفاوت در توالی نوکلئوتیدی و اسیدآمینه‌ای می‌تواند حاکی از تفاوت در منشا میزبانی باشد بنابراین فشار انتخاب در تنوع ژنتیکی جدایه‌ها دخالت داشته است.

متن کامل [PDF 657 kb]   (37 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشی کامل | موضوع مقاله: ژنتیک گیاهی
دریافت: 1398/7/15 | پذیرش: 1398/9/28 | انتشار: 1399/5/12

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به فصلنامه علمی ژنتیک نوین می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2020 All Rights Reserved | فصلنامه علمی ژنتیک نوین

Designed & Developed by : Yektaweb