دوره 17، شماره 1 - ( 1-1401 )                   جلد 17 شماره 1 صفحات 68-59 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Ebrahimi R, Abdollahi Mandoulakani B, Henareh M. Identification of SNPs in CYC-B and PSY1 genes responsible for fruit color in tomatore. MGj. 2022; 17 (1) :59-68
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1712-fa.html
ابراهیمی رقیه، عبدالهی مندولکانی بابک، هناره مشهید. شناسایی SNP ها در ژن‌های CYC-B و PSY1 دخیل در رنگ میوه گوجه‌فرنگی. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1401; 17 (1) :68-59

URL: http://mg.genetics.ir/article-1-1712-fa.html


دانشگاه ارومیه
چکیده:   (227 مشاهده)

به‌منظور شناسایی تنوعهای تک نوکلئوتیدی (Single nucleotide polymorphism) در ژن‌های بتا سیکلاز (CYC-B) و فیتون سنتاز (PSY1) در ۹۳ ژنوتیپ گوجهفرنگی و سه رقم تجاری، قطعاتی بهطول ۴۰۹ و ۱۰۰۰ جفتباز از نواحی کدکننده این دو ژن تکثیر شد. سپس جهت آشکارسازی چندشکلی در نواحی تکثیری این ژنها، هضم قطعات تکثیری با آنزیمهای برشی Tru1I وPstI  انجام گرفت ولی چندشکلی بین ژنوتیپها مشاهده نشد. بنابراین چهار فرد از جمعیتهای مختلف (ارومیه، سردشت، ترکیه و بوکان برای ژن CYC-B، ارومیه، سردشت، ترکیه و پیرانشهر برای ژن PSY1) انتخاب و قطعه تکثیری ژنها در این افراد توالییابی شد. بعد از بازیابی قطعه تکثیری هر ژن، شناسایی SNPها با استفاده از هم‌ردیفی توالی‌های هر ژن با نرم‌افزار Clustal Omega انجام گرفت. در ژن CYC-B هشت SNP شناسایی شد که ۷۵ درصد آنها از نوع همجنس با فراوانی ۵۰ درصد A/G، ۲۵ درصد  T/Cو ۲۵ درصد آنها از نوع غیر‌همجنس با فراوانی 5/12 درصد C/A و 5/12 درصد G/C بود. در ژن PSY1 نیز هشت SNP شناسایی شد که بهترتیب سه و پنج SNP در ناحیه‌ی اگزون و اینترون قرار داشت. 5/62 درصد این SNPها از نوع همجنس با فراوانی 5/37 درصد A/G، ۲۵ درصد T/C و 5/37 درصد آنها از نوع غیر‌همجنس با فراوانی ۲۵ درصد C/G و 5/12 درصد C/A بود. میانگین تعدادSNP ها به ازای هر ۱۰۰ جفتباز در قطعه تکثیر شده ژن CYC-B، 44/0 بود در حالیکه در نواحی اینترونی و اگزونی ژن PSY1 به‌‌ترتیب 26/1 و 71/0 بود. SNPهای شناسایی شده در این تحقیق میتواند در تهیه نقشههای ژنتیکی و همچنین شناسایی نشانگرهای عملکردی مرتبط با صفت رنگ میوه در گوجهفرنگی مورد استفاده قرار گیرد.

 
 
شماره‌ی مقاله: 6
متن کامل [PDF 1062 kb]   (57 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشی کامل | موضوع مقاله: ژنتیک گیاهی
دریافت: 1400/4/20 | پذیرش: 1400/10/28 | انتشار: 1401/1/21

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به فصلنامه علمی ژنتیک نوین می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2022 CC BY-NC 4.0 | فصلنامه علمی ژنتیک نوین

Designed & Developed by : Yektaweb