دوره 13، شماره 2 - ( 4-1397 )                   جلد 13 شماره 2 صفحات 235-246 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Asghari B, Dashab G. Comparision of accuracy of genomic breeding values for immunity characters by different Baysian approaches. MGj. 2018; 13 (2) :235-246
URL: http://mg.genetics.ir/article-1-60-fa.html
اصغری اسفدن بتول، داشاب غلامرضا. مقایسه صحت برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی صفات ایمنی با روش‌های مختلف بیزی. فصلنامه علمی ژنتیک نوین. 1397; 13 (2) :235-246

URL: http://mg.genetics.ir/article-1-60-fa.html


اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران
چکیده:   (650 مشاهده)

هدف از این مطالعه ارزیابی صحت مکان­‌‌‌‌‌یابی QTL و پیش‌بینی‌های ژنومی سه صفت ایمنی شامل تعداد سلول­های B، CD4 و CD8 بر اساس دو روش آمای بیزی شامل بیز و لاسو و GBLUP بر روی ۱۰۹۴ موش هتروژنوس بود. داده­های ژنوتیپی متشکل از ۱۰۹۴ حیوان با ۱۲۲۲۶ جایگاه‌های چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNPs) بر روی ۱۹ کروموزوم اتوزومی بعد از کنترل کیفیت داده‌های SNPs برای نرخ خوانش به ازای هر فرد و SNP و حداقل فراوانی آللی بودند. از هفت مدل آماری با در نظر گرفتن اثرات افزایشی و غالبیت نشانگرها و هم‌چنین آثار پلی­ژنیک حیوان برای برآورد اثر SNPs و پیش­بینی مؤلفه­های واریانس استفاده شد. اثر SNPها با روش بنفرونی تصحیح شد و صحت برآورد ارزش­های اصلاحی ژنومی با روش cross-validation ارزیابی شدند. مکان­یابی نهایی جایگاه­های کنترل کننده صفات کمی با هفت مدل و سه روش آماری برای سه صفت تعداد سلول­های B، CD4 و CD8 به ترتیب ۱۰، ۶ و ۷ QTL را بر روی کروموزوم­های ۱، ۳، ۵، ۷، ۸، ۹، ۱۲، ۱۴، ۱۶، ۱۷ و ۱۸ نشان داد. نتایج این مطالعه نشان داد که افزودن آثار افزایشی و غالبیت نشانگرها به همراه اثر پلی­ژنیک حیوان منجر به افزایش صحت پیش­بینی می‌شود. هم‌چنین، روش آماری نیز یکی از عامل‌های مؤثر در صحت پیش‌بینی‌های ژنومیک هستند. بالاترین پیش­­بینی ژنومیک برای تمام صفات مربوط به مدل ۷ و روش بیز لاسو بود. تفاوت بین روش­های آماری مربوط به پس­زمینه ژنتیکی و همچنین فرضیاتی است که برای میزان تنوع آثار نشانگرها در نظر گرفته می­شود.

متن کامل [PDF 1081 kb]   (275 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشی کامل | موضوع مقاله: ژنتیک جانوری
دریافت: 1395/12/4 | پذیرش: 1397/7/15 | انتشار: 1398/7/9

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


کلیه حقوق این وب سایت متعلق به فصلنامه علمی ژنتیک نوین می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2021 CC BY-NC 4.0 | فصلنامه علمی ژنتیک نوین

Designed & Developed by : Yektaweb